肺泡炎病因甚多常见的有含放线菌和真菌孢子、动植物蛋白质、细菌及其产物昆虫抗原和某些化学物质等有机尘埃。有些尘埃的抗原性质至今尚未明确。一般认为农民肺的病因主要是普通高温放线菌。近年来，国内学者相继报道了另一株与农民肺有关的高温放线菌一热吸水链霉菌在许多抗原中，以嗜热放线菌最为常见和重要，特别是微小多孢子菌其次是普通高温放线菌。该菌具有真菌的形态，但属于细菌在潮湿、温热、霉烂的有机物中孳生堆肥、泥土、食物和污染的水中含大量该菌农民吸入发霉的干草、谷物和蔗末等常易发病。